Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms