Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM47Q96LD4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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