Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTV1Q96GA3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms