Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms