Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.317e-7■■■■■ 44.1
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TBRG4Q969Z0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.227e-7■■■■■ 44.1
TBRG4Q969Z0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.187e-7■■■■■ 44.1
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TBRG4Q969Z0 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 43.6
TBRG4Q969Z0 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 43.6
TBRG4Q969Z0 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 43.6
TBRG4Q969Z0 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 43.6
TBRG4Q969Z0 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 43.6
TBRG4Q969Z0 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 43.5
TBRG4Q969Z0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.699e-7■■■■■ 43.5
TBRG4Q969Z0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.439e-7■■■■■ 43.5
TBRG4Q969Z0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.149e-7■■■■■ 43.5
TBRG4Q969Z0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.049e-7■■■■■ 43.5
TBRG4Q969Z0 NOC2L-205ENST00000487214 865 ntTSL 318.7■□□□□ 0.584e-6■■■■■ 43.5
TBRG4Q969Z0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 43.5
TBRG4Q969Z0 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 511.74□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 43.5
TBRG4Q969Z0 FARP1-231ENST00000600648 433 ntTSL 520.88■□□□□ 0.933e-15■■■■■ 43.5
TBRG4Q969Z0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.97e-7■■■■■ 43.4
TBRG4Q969Z0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.47e-7■■■■■ 43.4
TBRG4Q969Z0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 43.4
TBRG4Q969Z0 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.217e-7■■■■■ 43.4
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TBRG4Q969Z0 BAIAP2-224ENST00000575989 565 ntTSL 418.55■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 43.4
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