Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms