Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHX4

SPATA3, Spermatogenesis-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA3Q8NHX4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPATA3Q8NHX4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPATA3Q8NHX4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms