Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD1Q8NHV4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD1Q8NHV4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms