Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms