Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC191Q8NCU4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms