Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZC4

RTKN2, Rhotekin-2, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN2Q8IZC4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTKN2Q8IZC4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms