Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A9Q8IVB4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms