Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms