Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTE2Q6XPS3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms