Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms