Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms