Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRPF38BQ5VTL8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms