Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms