Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD1Q5SYB0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD1Q5SYB0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms