Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TDRD12Q587J7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms