Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms