Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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C4orf46Q504U0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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C4orf46Q504U0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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C4orf46Q504U0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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