Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms