Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC5A12Q1EHB4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC5A12Q1EHB4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms