Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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PTPRNQ16849 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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PTPRNQ16849 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRNQ16849 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms