Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNCBQ16143 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
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