Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN9AQ15858 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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