Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCEA2Q15560 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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