Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP1Q15431 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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