Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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ARHGEF6Q15052 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ARHGEF6Q15052 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ARHGEF6Q15052 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ARHGEF6Q15052 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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ARHGEF6Q15052 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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ARHGEF6Q15052 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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ARHGEF6Q15052 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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ARHGEF6Q15052 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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ARHGEF6Q15052 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ARHGEF6Q15052 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ARHGEF6Q15052 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ARHGEF6Q15052 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGEF6Q15052 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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