Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME4Q14997 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSME4Q14997 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
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