Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNB1Q14721 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNB1Q14721 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms