Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARF1Q14162 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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