Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDX39BQ13838 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
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