Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
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SHROOM2Q13796 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHROOM2Q13796 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
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SHROOM2Q13796 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
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SHROOM2Q13796 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
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SHROOM2Q13796 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
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SHROOM2Q13796 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
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SHROOM2Q13796 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
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SHROOM2Q13796 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
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SHROOM2Q13796 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
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SHROOM2Q13796 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
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SHROOM2Q13796 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SHROOM2Q13796 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHROOM2Q13796 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
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