Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms