Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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