Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRQ13535 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRQ13535 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRQ13535 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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