Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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