Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNL1Q0VF96 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNL1Q0VF96 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms