Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EP300Q09472 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EP300Q09472 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EP300Q09472 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EP300Q09472 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EP300Q09472 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EP300Q09472 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EP300Q09472 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EP300Q09472 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EP300Q09472 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EP300Q09472 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EP300Q09472 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EP300Q09472 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
EP300Q09472 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EP300Q09472 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EP300Q09472 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EP300Q09472 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EP300Q09472 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EP300Q09472 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EP300Q09472 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EP300Q09472 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EP300Q09472 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EP300Q09472 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms