Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms