Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms