Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms