Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLE4Q04727 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms