Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms