Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNTN2Q02246 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms