Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA4Q00056 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms