Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IP78347 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms