Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AQP4P55087 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AQP4P55087 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AQP4P55087 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AQP4P55087 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AQP4P55087 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AQP4P55087 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AQP4P55087 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AQP4P55087 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AQP4P55087 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AQP4P55087 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AQP4P55087 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AQP4P55087 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AQP4P55087 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AQP4P55087 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AQP4P55087 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AQP4P55087 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AQP4P55087 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms